产品简介
4D定量蛋白组学是基于布鲁克timsTOF质谱仪的定量蛋白组技术,4D是在传统3D蛋⽩质组学的三个维度,即保留时间(retention time)、质荷⽐(m/z)和离⼦强度(intensity)的分离基础上,增加了第四个维度(Collision cross-section,肽段的碰撞截⾯积)即离⼦淌度(ion mobility)的分离。
4D-DIA通过数据非依赖采集-同步累积连续碎裂(diaPASEF)扫描模式进行差异定量蛋白质组学分析,将DIA技术与基于timsTOF Pro上的diaPASEF技术相结合,具有高扫描速度和高灵敏度优势的同时,外加第四维离子淌度分离,使DIA数据在采集时不牺牲窗口循环速度的同时,降低谱图复杂度和提高离子利用率,实现了蛋白质组学在覆盖深度、灵敏度、通量方面的全面性提升。
检测方法流程
1、蛋白提取
2、蛋白酶解
3、质谱检测(tims TOF Pro)
4、搜库鉴定
5、数据分析
产品优势
通量高
样本免标记,不受标记定量蛋白组对样本数量的限制,通量高;
高灵敏
离子淌度加持,更适用于微量样本;
鉴定多
相较于传统DIA技术,鉴定深度更高;
适用广
可用于不同物种间的“有无差异蛋白”的比较;
数据分析结果

火山图

聚类热图

COG蛋白注释

蛋白富集气泡图

KEGG富集通路图

PPI互作网络图
应用方向
生物疾病标志物研究
生物疾病发生发展过程分子机制研究
化学或生物药物靶点研究
畜牧业领域
农业领域:农作物发育机制,抗逆研究
食品领域:提供食品安全,改善口感和营养程度的研究
样本要求
样本类型 | 4D-Label free | 4D-DIA | |
动物组织 | 常规组织(脑、心、肝、脾、肺、肾、肌肉等) |
20mg |
30mg |
坚硬组织(软骨、毛发) |
200mg |
300mg | |
植物组织 |
柔软组织(木本植物的叶,花等,草本植物,藻类,蕨类植物) |
200mg |
300mg |
坚硬组织(根、树皮、树枝、果实种子等) |
2g |
3g | |
细胞 |
悬浮/贴壁培养细胞(细胞计数/沉淀) |
5×10^6或20μL |
5×10^6或30μL |
液体类 |
血浆/血清/脑脊液(不去除高丰度) |
20μL |
20μL |
血浆/血清/脑脊液(去除高丰度) | 300μL |
500μL |
|
尿液 | 5mL |
10mL |
文献案例
溴氰菊酯对红鳌虾毒性的机制研究
Effects of cypermethrin on the hepatic transcriptome and proteome of the red claw crayfish Cherax quadricarinatus.