产品简介
数据非依赖性的扫描模式(Date-independent acquisition,DIA)是近几年发展的一种新的质谱数据采集方式。可以将质谱全扫描分为若干窗口,然后对每个窗口中的所有离子进行检测、碎裂,从而无遗漏、无差异地获得样本中所有离子的信息。目前流行的蛋白质组学研究手段,如ITRAQ、TMT、Label free、SILAC采用的都是数据依赖扫描模式(Date-dependent acquisition,DDA)。相对于DDA,DIA方法具有重复性好、蛋白覆盖率高、定量准确度高等特点,适用于大样本研究。
方法流程

产品优势
全息扫描
数据覆盖度大幅度提升,数据随机缺失值较少;
超高重现性、稳定性
肽段的选择没有随机性,重新性稳定性好;
高精确度
定量能力接近金标准PRM技术;
高通量
不受样本数量的限制,克服了标记定量对大批样本进行定量方法方面的缺陷;
数据分析结果

火山图

聚类热图

COG蛋白注释

蛋白富集气泡图

KEGG富集通路图

PPI互作网络图
应用方向
生物疾病标志物研究
生物疾病发生发展过程分子机制研究
化学或生物药物靶点研究
畜牧业领域
农业领域:农作物发育机制,抗逆研究
食品领域:提供食品安全,改善口感和营养程度的研究
样本要求
样本类型 | DIA | |
动物组织 | 常规组织(脑、心、肝、脾、肺、肾、肌肉等) | 30mg |
坚硬组织(软骨、毛发) |
300mg |
|
植物组织 |
柔软组织(木本植物的叶,花等,草本植物,藻类,蕨类植物) |
300mg |
坚硬组织(根、树皮、树枝、果实种子等) |
3g |
|
微生物 | 常见细菌、真菌菌体(菌体沉淀) | 100μL |
细胞 |
悬浮/贴壁培养细胞(细胞计数/沉淀) |
5×10^6或30μL |
液体类 |
血浆/血清/脑脊液(不去除高丰度) |
20μL |
血浆/血清/脑脊液(去除高丰度) | 500μL | |
卵泡液 (不去高丰度) |
100μL |
|
卵泡液(去除高丰度) |
2mL |
|
尿液 | 10mL | |
淋巴液、关节液、穿刺液 | 5mL | |
腹水 |
15mL |
文献案例
血清蛋白质组学鉴定银屑病及其中药疗效的生物标志物
In-depth serum proteomics reveals biomarkers of psoriasis severity and response to traditional Chinese medicine.