中心碳代谢靶向检测

中心碳代谢检测服务简介

中心碳代谢(CCM)传统意义上包括糖酵解途径(EMP)、磷酸戊糖途径(PPP)以及三羧酸循环途径(TCA)。中⼼碳代谢是⽣物体所需能量的主要来源,并为体内其他代谢提供前体物质,且CCM中关键酶的酶活及蛋⽩表达⽔平具有遗传分辨性,类似于表型,可⽤于⼤致的种属分辨。鉴于CCM在所有⽣命体中的重要作⽤,研究其代谢物的表达具有⾮常重要的意义。液质联⽤⽅法(LC-QQQ-MS)可以⾼通量检测样本中⼼碳代谢通路中各物质的含量,通过数据分析以确定物质间的变化关系。

检测流程

011

试验设计及样品收集

猝灭样品干冰运输
022

代谢物提取

有机溶剂提取
033

标准品配置与代谢物检测

建立标准曲线后进行LC/GC-MS检测
044

生物信息学分析

差异化合物筛选,模式热图等可视化分析

产品优势

数据分析结果

火山图
火山图
小提琴图
小提琴图
聚类热图
聚类热图
箱线图
箱线图
OPLS-DA得分图
OPLS-DA得分图
pca分析图
PCA分析
veen图(Venn diagram、文氏图、维恩图)
veen图
KEGG富集分析条形图
KEGG富集分析条形图
KEGG富集分析气泡图
KEGG富集分析气泡图
KEGG富集分析网络图
雷达图
雷达图
代谢物相关性热图
代谢物相关性热图

应用方向

样本要求

样本类型 样本 推荐送样量 最低送样量 生物学重复
植物组织 茎/芽/节/叶/根/花/果实/愈伤组织 600mg 300mg 3
液体 根系分泌物/发酵液/酒/组织液/蜂蜜/花蜜/油/中药煎剂/提取液/菌液/果汁 500uL 100uL 3
特殊样本 培养样本,存在液体 600mg 300mg 3

文献案例

重症 COVID-19患者中的中性粒细胞代谢组学揭示 GAPDH 是中性粒细胞细胞外陷阱形成的抑制因子。

Neutrophil metabolomics in severe COVID-19 reveal GAPDH as a suppressor of neutrophil extracellular trap formation.

缺氧应激对中心谈代谢稳态的调节机制。

Plant stem cells under low oxygen: metabolic rewiring by phytoglobin underlies stem cell functionality.
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