花青素靶向代谢组学简介

花青素是决定植物花颜色的重要色素之一。花青素是一类水溶性的色素,存在于植物表皮细胞的液泡中,呈现橙色、红色至蓝色。以花青素为主要色素的花色从橙色到红、紫、蓝、黑色,显现出十分广泛的色系,这在很大程度上是由于花青素化学结构上的微小差别,或者化学结构虽然相同,但由于溶液的物理或化学条件不同也会产生色调的变化。

花青素靶向代谢组学针对目前研究中最常见的110种花青素构建了靶向数据库,能够一次性精准定位关注代谢物的含量差异,为研究植物各种调控机制提供新的方向。

方法流程

011

试验设计及样品收集

猝灭样品干冰运输
022

代谢物提取

有机溶剂提取
033

标准品配置与代谢物检测

建立标准曲线后进行LC/GC-MS检测
044

生物信息学分析

差异化合物筛选,模式热图等可视化分析。

我们的服务优势

数据分析结果

火山图

火山图

小提琴图

小提琴图

聚类热图

聚类热图

箱线图

箱线图

OPLS-DA得分图

OPLS-DA得分图

pca分析图

PCA分析

veen图(Venn diagram、文氏图、维恩图)

veen图

KEGG富集分析条形图

KEGG富集分析条形图

KEGG富集分析气泡图

KEGG富集分析气泡图

KEGG富集分析网络图

雷达图

雷达图

代谢物相关性热图

代谢物相关性热图

应用方向

植物抗逆胁迫机制研究;
植物色泽品质研究;
药用植物活性成分研究;
药用植物活性成分在疾病治疗中的研究;

样本要求

样本类型 样本 推荐送样量 最低送样量 生物学重复
植物组织 茎/芽/节/叶/根/花/果实/愈伤组织 600mg 300mg 3
液体 根系分泌物/发酵液/酒/组织液/蜂蜜/花蜜/油/中药煎剂/提取液/菌液/果汁 500uL 100uL 3
特殊样本 培养样本,存在液体 600mg 300mg 3

文献案例

兰花中B和AGL6 MADS-box基因的多功能进化

Multifunctional evolution of B and AGL6 MADS box genes in orchids.

玉米中一种非常规的原花青素途径

An unconventional proanthocyanidin pathway in maize

转录组和长非编码RNA分析揭示了高CO2处理延缓草莓采后成熟和衰老的潜在分子机制

Transcriptome combined with long non-coding RNA analysis reveals the potential molecular mechanism of high-CO2 treatment in delaying postharvest strawberry fruit ripening and senescence
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