产品简介
4D定量蛋白组学是基于布鲁克timsTOF质谱仪的定量蛋白组技术，4D是在传统3D蛋⽩质组学的三个维度，即保留时间（retention time）、质荷⽐（m/z）和离⼦强度（intensity）的分离基础上，增加了第四个维度（Collision cross-section，肽段的碰撞截⾯积）即离⼦淌度（ion mobility）的分离。
4D-Label-free技术是对传统Labelfree蛋⽩质组学的升级，它将数据依赖采集（DDA）与同步累积连续碎裂（PASEF）相结合，外加第四维度的离子淌度分离（基于肽段的碰撞截面积CCS进行分），提高离子利用率和准确度，实现蛋⽩质组学在覆盖深度、灵敏 度、通量⽅⾯的全⾯性提升。
检测方法及流程
1、蛋白提取
2、蛋白酶解
3、质谱检测(tims TOF Pro)
4、搜库鉴定
5、数据分析
产品优势
通量高
样本免标记，不受标记定量蛋白组对样本数量的限制，通量高
高灵敏
离子淌度加持，更适用于微量样本
鉴定多
相较于传统lable free技术，鉴定深度更高
适用广
可用于不同物种间的“有无差异蛋白”的比较
数据分析结果
火山图
聚类热图
COG蛋白注释
蛋白富集气泡图
KEGG富集通路图
PPI互作网络图
应用方向
生物疾病标志物研究
生物疾病发生发展过程分子机制研究
化学或生物药物靶点研究
畜牧业领域
农作物发育机制，抗逆研究
提供食品安全，改善口感和营养程度的研究
样本要求
| 样本类型 | 4D-Label free | 4D-DIA | |
| 动物组织 | 常规组织（脑、心、肝、脾、肺、肾、肌肉等） |
20mg |
30mg |
| 坚硬组织（软骨、毛发） |
200mg |
300mg | |
| 植物组织 |
柔软组织（木本植物的叶，花等，草本植物，藻类，蕨类植物） |
200mg |
300mg |
|
坚硬组织（根、树皮、树枝、果实种子等） |
2g |
3g | |
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细胞 |
悬浮/贴壁培养细胞（细胞计数/沉淀） |
5×10^6或20μL |
5×10^6或30μL |
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液体类 |
血浆/血清/脑脊液（不去除高丰度） |
20μL |
20μL |
| 血浆/血清/脑脊液（去除高丰度） | 300μL |
500μL |
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| 尿液 | 5mL |
10mL |
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文献案例
溴氰菊酯对红鳌虾毒性的机制研究
Effects of cypermethrin on the hepatic transcriptome and proteome of the red claw crayfish Cherax quadricarinatus.