空间代谢组简介

代谢物积累是物质表型的基础,是研究基因功能与表型变化的桥梁,因此代谢组学在动植物学研究中应用广泛,如生长发育、生物胁迫、非生物胁迫、疾病治疗、药物靶向研究等。空间代谢组是基于质谱成像技术发展而来的新兴技术,通过质谱成像技术可对不同组织器官中的代谢物进行定性、定量、定位三个维度的分析,从而突破传统代谢组研究损失空间信息的瓶颈。空间代谢组学作为一种新型的分子影像技术,能够直接从生物组织中获得大量已知或未知的内源性代谢物和外源性药物等分子的结构、含量和空间分布信息,还可用于研究特定物质空间分布,并辅助绘制物质合成通路。

方法流程

1、样本准备
2、组织包埋
3、组织切片
4、基质喷涂
5、上机检测
6、数据分析

产品优势

项目经验丰富

丰富的组织类型检测;

优质平台

TIMS-TOF FLEX MALDI 2是Bruker目前最新和性能最好的质谱成像平台;

高分辨率

Smartbeam3D激光控制器,最高实现5μm亚细胞水平,是目前高空间分辨率应用文献中的主流技术;

更广的检测范围和通量

MALDI 2离子源通过两束激光激发,可以分析传统空间代谢无法分析的代谢物及药物类型,以及提升低丰度代谢物信号强度。

数据分析结果

火山图
火山图
小提琴图
小提琴图
聚类热图
聚类热图
箱线图
箱线图
OPLS-DA得分图
OPLS-DA得分图
pca分析图
PCA分析
veen图(Venn diagram、文氏图、维恩图)
veen图
KEGG富集分析条形图
KEGG富集分析条形图
KEGG富集分析气泡图
KEGG富集分析气泡图
KEGG富集分析网络图
KEGG富集分析网络图
雷达图
雷达图
代谢物相关性热图
代谢物相关性热图

应用方向

肿瘤微环境
药物代谢
免疫功能
逆境胁迫
炎症发展
生长发育
营养品质

文献案例

空间分辨多组学揭示胃癌细胞特异性代谢重编程与互作

Spatially resolved multi-omics highlights cell-specific metabolic remodeling and interactions in gastric cancer.

生物强化番茄为维生素D的充足提供了一条新的途径

Biofortified tomatoes provide a new route to vitamin D sufficiency.
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