升级上新 | 非靶代谢组结题报告焕新:分类注释直达,附全报告保姆级解读

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        代谢组研究,拿到结题报告只是第一步,从海量峰图、代谢物列表里挖出具生物学意义的结论,才是研究的核心。为了让大家更高效地梳理物质信息、快速锁定研究方向,我们对动物非靶代谢组标准结题报告完成了功能升级;同时整理了这份全模块深度解读,从升级亮点到图表拆解,手把手带你吃透代谢组报告。

01 本次升级核心:代谢物分类注释全面细化

         本次更新最大的优化,是在所有代谢物结果表格中,新增了 ** 代谢物一级分类(Class I)与二级分类(Class II)** 信息,且同步配套中英文双语标注。

① 快速归类,一眼把握物质属性

无需额外检索数据库,直接就能判断差异代谢物的化学类别——是氨基酸、脂质、维生素还是杂环类物质发生了显著变化,快速建立对差异表型的整体认知

② 批量筛选,提升数据整理效率

可直接按一级/二级分类批量筛选目标物质,比如重点关注脂质代谢方向,就能一键筛选出所有脂质类差异代谢物,省去手动分类的繁琐步骤。

③ 互相印证,支撑功能机制解释

物质分类结果可与后续KEGG通路富集结果形成互补印证,让代谢表型变化的机制解释更严谨、更有层次。

02 动物非靶代谢组结题报告全模块解读

模块1:数据质量评估

QC样本重复性:评估仪器稳定性

       QC样本是将所有待测样本等比例混合得到的参照样本,上机过程中每隔若干样本插入一针,用于监测质谱信号的漂移。

        核心判断标准:QC样本间斯皮尔曼相关系数>0.8,即认为仪器稳定性良好;PCA图中QC样本聚集越紧密,系统误差越小。

组内样本重复性:评估生物学重复稳定性

         组内重复性越好,后续筛选出的差异代谢物可靠性越高,模型预测能力也越强。

         核心判断标准:样本相关性热图中组内相关系数越高、PCA图中同组样本聚集越紧密,组内重复性越好。

组间样本差异性:初步判断差异幅度

        通过PCA图可直观观察不同分组的整体分离程度,组间分离越明显,说明两组代谢表型差异越大,后续显著差异代谢物的占比通常也越高。

模块2:代谢物注释结果 

KEGG数据库注释:

        将代谢物对应到具体生物通路中,是后续功能富集分析的基础。

HMDB数据库注释:

        按化学结构进行系统分类,也是本次新增的一二级分类的核心数据来源,从化学属性层面呈现代谢物组成分布。

Lipidmaps数据库注释

      针对脂质的专业分类数据库,将脂质划分为8大类,适合聚焦脂质代谢方向的研究。

模块3:差异代谢物筛选 

筛选标准

差异倍数(FC):反映物质含量的变化幅度

VIP值:来自OPLS-DA模型,反映物质对组间区分的贡献度,默认VIP≥1为显著

P值:t检验统计学显著性,默认P<0.05为显著差异

火山图:一图总览差异全貌:

        横坐标为 log₂(FC),纵坐标为-log₁₀(P值);红色为显著上调、蓝色为显著下调、灰色为无显著差异。可快速判断两组差异的整体趋势,以及上下调物质的数量分布。

OPLS-DA得分图:

        有监督的多元统计方法,专门放大组间差异、过滤组内随机波动。重点关注 Q₂Y指标:Q₂Y>0.5即模型有效,>0.9为出色模型;需配合置换检验共同判断,避免模型过拟合。

差异代谢物聚类热图:

        直观展示差异物在各组的表达模式。红色代表高含量,蓝色代表低含量;若同组样本能清晰聚类,说明差异物的表达模式具备组内一致性。

此外还有Top差异倍数柱状图、小提琴图、箱线图等,可分别用于锁定变化幅度最大的物质、查看单个物质的组内含量分布与离散程度。

模块4:KEGG通路富集分析

富集柱状图/点图:

          最核心的富集结果展示。重点关注富集因子(Rich Factor)和P值:富集因子越大、P值越小,说明该通路富集程度越显著,越可能是核心调控通路。

差异丰度得分图

        可直观判断每条通路的整体变化方向(上调/下调),避免只看富集数量、忽略变化趋势的问题。

KEGG通路图

       将差异代谢物直接映射到通路图中,红色标记上调、绿色标记下调,清晰呈现通路上的关键变化节点,方便梳理完整的代谢调控机制。

模块5:进阶分析

ROC曲线分析

        用于评估代谢物作为生物标志物的诊断效能,AUC值越接近1,组间区分能力越强,尤其适合疾病模型、生物标志物筛选类研究。

k-means聚类分析

         将所有差异代谢物按含量变化趋势划分为不同类别,同一类别的代谢物可能存在相似的功能或调控关系,适合多处理梯度、多时间点的实验设计。

韦恩图与共有差异物分析

多组比较场景下,可快速找到不同比较组共有的差异代谢物,以及各组特有的差异代谢物,进一步区分核心响应通路和特异性响应通路。

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